一、使用方法
1. 在主界面输入目标基因名(如 TP53、Trp53、thrA)
2. 选择目标物种(人类、小鼠或细菌)
3. 点击“查询”,系统将返回预测的植物 miRNA 候选靶点及相关参数
二、参数设置说明
平台采用以下两个关键参数对候选结果进行筛选与可信度评估:
- 配对得分(Score)≥ 140
- 最低结合能(MFE)≤ –17 kcal/mol
相关参数说明如下:
1. Score(配对得分)
碱基配对得分,考虑 seed 区完全性、mismatch、wobble 配对等因素。Score ≥ 140 为高可信,该阈值为 miRanda 等主流预测工具推荐标准。
2. Minimum Free Energy (MFE,最低结合能)
反映 miRNA–mRNA 杂交结构的热力学稳定性,MFE 越低(数值越负),结合越稳定。平台默认阈值为 ≤ –17 kcal/mol,为跨物种预测中平衡灵敏度与特异性的推荐值。