一、使用方法

1. 在主界面输入目标基因名(如 TP53、Trp53、thrA)

2. 选择目标物种(人类、小鼠或细菌)

3. 点击“查询”,系统将返回预测的植物 miRNA 候选靶点及相关参数

二、参数设置说明

平台采用以下两个关键参数对候选结果进行筛选与可信度评估:

  • 配对得分(Score)≥ 140
  • 最低结合能(MFE)≤ –17 kcal/mol

相关参数说明如下:

1. Score(配对得分)

碱基配对得分,考虑 seed 区完全性、mismatch、wobble 配对等因素。Score ≥ 140 为高可信,该阈值为 miRanda 等主流预测工具推荐标准。

2. Minimum Free Energy (MFE,最低结合能)

反映 miRNA–mRNA 杂交结构的热力学稳定性,MFE 越低(数值越负),结合越稳定。平台默认阈值为 ≤ –17 kcal/mol,为跨物种预测中平衡灵敏度与特异性的推荐值。